Questões de Concurso Comentadas para UFRJ

Q2065962

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065962 Biologia

A técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) é largamente utilizada em biologia molecular. Atualmente diversas técnicas de PCR modificadas são utilizadas com objetivos específicos. De acordo com o exposto, assinale a alternativa correta.

A

A PCR em duas etapas ou nested PCR consiste na utilização de dois pares de iniciadores na mesma reação para aumentar a sensibilidade da reação.

B

A PCR inverso é utilizado para amplificar fragmentos de DNA linear através de PCR, no qual apenas a sequência de um fragmento interno desta sequência é conhecida.

C

A PCR de fusão consiste na fusão de sequências de DNA conhecidas através de PCR, no qual alguns iniciadores devem ter homologia de bases entre si.

D

A PCR tradicional consiste de dois iniciadores com sentidos opostos que se anelam na mesma fita simples de DNA, promovendo a amplificação do fragmento localizado entre eles.

E

Na PCR multiplex, pares de iniciadores diferentes são utilizados para amplificação de alvos distintos, em amostras diferentes.

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Q2065961

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065961 Biologia

Sobre as diferentes maneiras de detecção de PCR em tempo real, assinale a alternativa INCORRETA.

A

A curva de melting é uma ferramenta utilizada para aumentar a especificidade das reações realizadas com SYBR Green.

B

A metodologia de Taqman consiste na utilização de dois iniciadores e uma sonda marcada nas suas extremidades com um fluoróforo e um quencher, sonda esta que se anela ao molde entre os iniciadores.

C

O SYBR Green é uma metodologia menos específica do que a metodologia Taqman.

D

A curva de melting é uma ferramenta que pode ser utilizada para a determinação de polimorfismos entre as amostras.

E

Algumas sondas utilizadas na metodologia de Taqman possuem duas moléculas quencher: uma numa extremidade e outra no interior da sequência da sonda, impedindo o escape de sinal inespecífico.

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Q2065960

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065960 Biologia

Sobre o PCR em tempo real ou PCR quantitativo (qPCR), assinale a alternativa INCORRETA.

A

O PCR em tempo real é mais sensível do que o PCR tradicional, devido a seu método de detecção da amplificação.

B

Uma curva de fluorescência de PCR em tempo real pode ser dividida em 3 fases: exponencial, linear e de plateau. A quantificação da amostra deve ser realizada na fase linear.

C

A eficiência da amplificação de duas amostras com sequências conservadas com os mesmos reagentes de PCR quantitativo deve ser teoricamente igual.

D

O Ct de uma reação de amplificação é um dos parâmetros utilizados para a quantificação das amostras.

E

A detecção da fluorescência do Sybr-green (detecção inespecífica) deve ser feita durante a fase de extensão da reação de qPCR.

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Q2065959

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065959 Biologia

As técnicas de sequenciamento de Nova Geração (NGS) baseiam-se em uma amplificação clonal antes da reação de sequenciamento em si. No entanto, cada equipamento utiliza uma técnica diferente de amplificação clonal. Sobre estas técnicas, assinale a opção correta.

A

Uma das técnicas utilizadas é o PCR em ponte, no qual as fitas de DNA são dispersas em uma placa, aleatoriamente, e o PCR realizado através de pareamento de bases com fitas de DNA presentes nesta placa; esta técnica é utilizada na metodologia do sequenciador 454.

B

Uma das técnicas utilizadas é o PCR em ponte, no qual as fitas de DNA são dispersas em uma placa aleatoriamente e o PCR realizado através de pareamento de bases com fitas de DNA presentes nesta placa; esta técnica é utilizada na metodologia do sequenciador Ion Torrent.

C

A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador Ion Torrent e consiste de uma emulsão de água em uma fase oleosa, formando gotículas de óleo que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciado e uma “bead” para sua ancoragem.

D

A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador Illumina e consiste de uma emulsão de água em uma fase oleosa, formando gotículas de água que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciado e uma “bead” para sua ancoragem.

E

A PCR em emulsão é uma técnica utilizada na metodologia do sequenciador 454 e consiste em uma emulsão de água, em uma fase oleosa, formando gotículas de água que contêm os reagentes de PCR, uma fita de DNA a ser sequenciado e uma “bead” para sua ancoragem.

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Q2065958

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065958 Biologia

O método de Sanger baseia-se em uma reação de sequenciamento com utilização de terminadores de cadeia (didesoxinucleotídeos, ddNTPs) marcados com fluorescência, além de nucleotídeos naturais (dNTPs). Originalmente, o produto da reação era submetido a uma eletroforese em gel de poliacrilamida que permitia realizar a leitura da sequência inicial de DNA. Atualmente, a eletroforese é feita em capilar dentro dos sequenciadores automáticos. Sobre o método, assinale a opção correta.

A

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada com dois iniciadores por reação e uma mistura de nucleotídeos dNTPs e ddNTPs, onde os ddNTPs encontram-se em maior quantidade do que os dNTPs, e a leitura da sequência é realizada de baixo para cima no gel de poliacrilamida (sentido 5’-3’ da fita nascente), após a eletroforese.

B

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada com apenas um iniciador por reação e uma mistura de nucleotídeos (dNTPs) e didesoxinucleotídeos (ddNTPs), onde os dNTPs encontram-se em maior quantidade do que os ddNTPs e a leitura da sequência é realizada de baixo para cima no gel de poliacrilamida (sentido 5’-3’ da fita nascente), após a eletroforese.

C

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada com apenas um iniciador por reação e uma mistura de nucleotídeos (dNTPs) e didesoxinucleotídeos (ddNTPs), onde os ddNTPs encontram-se em maior quantidade do que os dNTPs e a leitura da sequência é realizada de baixo para cima no gel de poliacrilamida (sentido 5’-3’ da fita nascente) após a eletroforese.

D

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada com dois iniciadores por reação e uma mistura de nucleotídeos (dNTPs) e didesoxinucleotídeos (ddNTPs), onde os ddNTPs encontram-se em maior quantidade do que os dNTPs e a leitura da sequência é realizada de cima para baixo no gel de poliacrilamida (sentido 5’-3’ da fita nascente), após a eletroforese.

E

A reação de sequenciamento de Sanger é realizada com apenas um iniciador por reação e uma mistura de nucleotídeos (dNTPs) e didesoxinucleotídeos (ddNTPs), onde os ddNTPs encontram-se em maior quantidade do que os dNTPs e a leitura da sequência é realizada de cima para baixo no gel de poliacrilamida (sentido 5’-3’ da fita nascente), após a eletroforese.

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Q2065957

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065957 Biologia

Muitos plasmídeos de expressão em E. coli têm expressão controlada pela adição de IPTG (Isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido) ao meio de cultura. Sobre esse método de indução, assinale a alternativa INCORRETA.

A

A indução controlada é importante para prevenir efeitos tóxicos da proteína de interesse.

B

O IPTG é um análogo da lactose que não é metabolizado pelas células.

C

O IPTG age induzindo a replicação do gene de interesse.

D

O IPTG age sobre promotores controlados pelo repressor lacI.

E

Em plasmídeos com o promotor T7, o IPTG induz a expressão da polimerase T7 presente em bactérias da linhagem DE3.

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Q2065956

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065956 Biologia

Um laboratório quer expressar a amilase salivar de bovinos para fins biotecnológicos. Assinale a alternativa que indica como o isolamento do gene pode ser feito.

A

A saliva é coletada e incubada com enzimas de restrição específicas para a clonagem do gene da amilase salivar no plasmídeo de interesse.

B

A saliva é coletada, o material genético total é extraído e incubado com a enzima ligase na presença do plasmídeo de interesse.

C

É feito um extrato do tecido animal e a proteína de interesse é isolada por técnicas bioquímicas.

D

O material genético é extraído do tecido animal e é utilizada a técnica de RT- PCR com iniciadores específicos, para amplificar a sequência da amilase salivar.

E

É feita a cultura de células da glândula salivar e o DNA nuclear contendo o gene de interesse é transferido para a bactéria.

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Q2065955

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065955 Biologia

Trabalha-se na purificação de uma proteína de 50 kDa. Após uma etapa de precipitação por sulfato de amônio, foi constatada a presença de uma proteína contaminante de 10 kDa. Dos métodos listados a seguir, assinale aquele que é adequado para separação em larga escala.

A

SDS-PAGE.

B

Espectrometria de massas.

C

Ultracentrifugação contra colchão de sacarose.

D

Cromatografia por gel filtração.

E

Eletroforese em gel de agarose.

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Q2065954

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065954 Biologia

Assinale a alternativa que apresenta características dos vetores de expressão baseados em baculovírus.

A

É um vetor lentiviral utilizado em células eucarióticas.

B

São vetores de expressão classicamente utilizados em células de inseto, mas que podem ser adaptados para expressão em células de mamíferos.

C

É obrigatoriamente dependente de mecanismos de seleção, como resistência a antibióticos ou marcadores auxotróficos.

D

Utiliza o promotor forte da poliedrina, que é derivado de células de insetos.

E

Por serem pequenos vírus de RNA, não comportam insertos com mais de 500 pb.

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Q2065953

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065953 Biologia

Assinale a alternativa que descreve corretamente as propriedades de um vetor de expressão de proteínas heterólogas.

A

Os plasmídeos de expressão em E. coli contêm um mesmo promotor para indução do gene de seleção e do gene heterólogo.

B

Plasmídeos de expressão em E. coli possuem sítios múltiplos de clonagem, que devem estar entre o promotor indutível e a sequência Shine-Dalgarno.

C

Geralmente contém uma abundância de sítios de restrição que podem ser escolhidos livremente para clonagem, desde que o gene heterólogo contenha um códon de iniciação e de parada da tradução.

D

Plasmídeos de expressão em células de mamífero que são destinados à integração no genoma requerem origem de replicação derivado de vírus, como SV40 ou Epstein-barr.

E

Alguns plasmídeos de expressão em células de mamífero podem ser propagados em E. coli, mas não em células de mamíferos.

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Q2065952

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065952 Biologia

Assinale a alternativa que apresenta corretamente as vantagens e/ou desvantagens da expressão de proteínas heterólogas em Pichia pastoris.

A

É um organismo capaz de reproduzir, sempre fielmente, o padrão de glicosilação observado em células de mamífero.

B

Por ser uma bactéria, o meio de cultura é mais econômico que o utilizado na expressão em células de mamífero.

C

Na expressão induzida por metanol, não é necessário que a cultura seja bem oxigenada, já que esse é um processo anaeróbio.

D

É possível fazer a clonagem pelo processo de recombinação homóloga que permite a inserção de cassetes de expressão no DNA genômico.

E

Como possui parede celular, a proteína é sempre retida na célula, portanto o processo de purificação é mais trabalhoso.

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Q2065951

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065951 Biologia

Trabalha-se na expressão de uma proteína fusionada a uma cauda de poli-histidina. A purificação será pelo método de cromatografia por afinidade em resina conjugada ao níquel. Considerando o principio de interação desse método de purificação, assinale a alternativa INCORRETA.

A

É adequado o uso de tampões com valores de pH, variando de 2-8.

B

O uso de inibidores de protease é adequado, desde que não contenham EDTA e a eluição não dependa de clivagem proteolítica.

C

A concentração de imidazol no tampão de ligação pode ser otimizada para prevenir interações inespecíficas.

D

O método é compatível com tampões desnaturantes contendo altas concentrações de uréia.

E

A eluição da proteína de interesse pode ser feita com um tampão contendo alta concentração de imidazol.

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Q2065949

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065949 Biologia

Assinale a alternativa que apresenta e descreve corretamente o método utilizado para introduzir plasmídeos em células de bactéria E.coli no laboratório.

A

Transformação; um lisado de células é incubado com o DNA e é submetido a uma corrente elétrica.

B

Microinjeção; células são manipuladas ao microscópio e o DNA é introduzido com ajuda de uma agulha.

C

Infecção; bacteriófagos são utilizados para a introdução do DNA de interesse.

D

Transfecção; DNA é transferido para um lisado de células, através do uso de lipofectamina.

E

Transformação; células são incubadas com o DNA na presença de cloreto de cálcio e recebem um choque térmico.

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Q2065948

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065948 Biologia

As enzimas de restrição são:

A

endonucleases sítio-específicas.

B

proteases que clivam peptídeos em sequências específicas.

C

ribonucleases que degradam RNA mensageiro após a sua síntese.

D

enzimas que agem na membrana, restringindo a entrada de moléculas na célula.

E

capazes de unir fragmentos de DNA.

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Q2065947

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065947 Biologia

No primeiro ciclo de PCR utilizando DNA genômico, os iniciadores de DNA começam a síntese, que só termina quando o ciclo acabar, ou quando uma extremidade aleatória de DNA é encontrada. Agora, no final de 20 a 30 ciclos - uma amplificação típica - o único produto visível é definido, precisamente, pelas extremidades dos iniciadores de DNA. Assinale a alternativa que indica os ciclos em que é gerado um fragmento de fita dupla com o tamanho correto.

A

Em todos a partir do 4º .

B

Apenas nos 2 últimos ciclos.

C

Em todos a partir do 2º .

D

Apenas no 2º e 3º ciclos.

E

Em todos os ciclos.

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Q2065946

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065946 Biologia

O conhecimento da existência do RNAi ou Interferência do RNA e de como ele é ativado nas células eucariontes propiciou o advento de inúmeras técnicas de estudo de genes e suas funções, gerando ferramentas muito importantes para os estudos de biologia molecular. Uma destas técnicas é:

A

a superexpressão de genes alvos em sistemas celulares.

B

o silenciamento de genes através do uso de plasmidios/vetores “sh” ou de oligos de dupla fita de RNA.

C

o “knockdown” de genes em E. coli.

D

o CRISP.

E

o uso de vetores virais como vacinas.

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Q2065945

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065945 Biologia

Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido. Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer a seguinte ferramenta de bionformática:

A

Mega.

B

Multialignm.

C

Velvet.

D

Genbank.

E

Blast.

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Q2065943

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065943 Biologia

Com o advento das técnicas modernas de sequenciamento e análise de proteínas, novos nomes foram criados na área de biologia molecular a fim de descrever estudos relacionados à identificação e à análise de genomas completos, a perfis de expressão de genes sob determinada condição ou situação, ou, ainda, a identificação do perfil de proteínas expressas em determinada condição ou situação. Dentro desse contexto, é INCORRETO afirmar que:

A

genômica é o nome dado a um ramo da bioquímica ou biologia molecular que estuda o genoma completo de um organismo.

B

a análise do perfil global de expressão gênica é conhecida como transcriptoma.

C

a análise sistemática das proteínas presentes em determinada situação recebe o nome de proteómica.

D

a genômica funcional é um ramo da biologia molecular cujo objetivo principal é entender a relação entre o genoma de um organismo e seu fenótipo.

E

entende-se por genômica o ramo da genética que aplica a tecnologia do DNA recombinante e os métodos de sequenciamento de DNA sem utilizar a bioinformática, para sequenciar, montar e analisar a função e a estrutura dos genomas dos diferentes organismos.

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Q2065942

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065942 Biologia

Sequenciamento de nova geração, conhecido também como NGS ou sequenciamento profundo de ácidos nucleicos, é um termo geral utilizado para descrever uma série de tecnologias modernas de sequenciamento. Sobre esta tecnologia é correto afirmar que:

A

Illumina (Solexa), 454 (Roche) e Ion Torrent (Próton/PGM) são sequenciadores de nova geração que realizam o sequenciamento direto tanto de DNA quanto de RNA.

B

Uma das maiores vantagens das tecnologias de sequenciamento de nova geração é o fato de que as sequências obtidas geralmente são longas, contendo, ao menos, 1 kilobases.

C

Apesar dos inúmeros avanços gerados pelas técnicas de sequenciamento de nova geração, ainda é tecnicamente impossível utilizá-las para analisar os genes que estão sendo expressos em um determinado tecido ou condição.

D

Uma das restrições ao uso do sequenciamento de nova geração é a necessidade de serem utilizadas amostras grandes com alta concentração de ácidos nucleicos.

E

as tecnologias recentes de sequenciamento de ácidos nucleicos permitem sequenciar tanto DNA como RNA de forma mais rápida e barata do que anteriormente era conseguido com o sequenciamento de Sanger e, por conta disto, estão revolucionando os estudos de genomas e a biologia molecular.

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Q2065941

Ano: 2016 Banca: PR-4 UFRJ Órgão: UFRJ Prova: PR-4 UFRJ - 2016 - UFRJ - Biólogo - Biologia Molecular |

Q2065941 Biologia

Sobre PCR em tempo real, é correto afirmar que:
I- Caso se queira determinar os níveis de expressão de determinado transcrito é necessário o uso de genes constitutivos ou “housekeeping”; II- Esta técnica oferece a limitação de analisar apenas DNA, não podendo ser usado como ferramenta para análise da expressão de genes; III- Apesar de ser mais simples e barata do que a técnica de “northern blot” ainda necessita do uso de isótopos radioativos.
Assinale a alternativa que apresenta a(s) afirmativa(s) correta(s).

A

I

B

II

C

III

D

I, II e III

E

II e III

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