Questões de Concurso Público FIOCRUZ 2010 para Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA

Um pesquisadora coletou no campo vários indivíduos que ela classificou como pertencentes ao gênero Drosophila, mas sem designar espécies. Após o sequenciamento de uma região gênica, ela alinhou duas sequências, cujo número de diferenças está mostrado na tabela par a par abaixo. As células da diagonal indicam o número de bases idênticas e nas demais células, o número de substituições observáveis na comparação de sequências alinhadas de dois indivíduos. 

                                        

Sobre a tabela, analise as afirmativas a seguir.

I. As sequências pertencem a mesma espécie, pois o número de diferenças entre elas é baixo.

II. As sequências estão evoluindo sob ação da seleção purificadora.

III. Existe um desvio a favor das transições, esperado em regiões gênicas não codificadoras de proteínas.

Assinale: 

Veja o gráfico abaixo que destaca o aumento na distância observável entre duas sequências com o aumento do número de mutações acumuladas desde o ancestral comum entre elas (distância real).

                                 

A partir do gráfico, analise as afirmativas a seguir.

I. Sequências mais próximas filogeneticamente apresentam uma proporção menor de variação genética escondida.

II. Caso o número de nucleotídeos diferentes (A,T,C,G) fosse seis ao invés de quatro, a distância observável teria um platô abaixo do observado.

III. A distância observável varia de zero a um, enquanto a real de zero a infinito.

Assinale: 

Um pesquisador estava fazendo um estudo comparativo entre genomas de duas espécies de plantas. Em particular, ele analisou sequências de dois genes não homólogos codificadores de proteínas. Dentre as metodologias de análise, ele calculou a proporção de nucleotídeos diferentes pelo total de nucleotídeos comparados (p).

Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. Quando comparado com íntrons do mesmo gene, os éxons vão mostrar um p maior entre as espécies de plantas.

II. As proteínas não homólogas irão mostrar uma proporção de 25% de aminoácidos idênticos.

III. O numerador de p é exatamente o somatório do número de transições com o de transversões entre as sequências.

Assinale: 

Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é: 

Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

A explicação mais provável é que: 

A maior parte dos algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências faz uso de uma matriz de pontos (dot-matrix). Na primeira fase do alinhamento par a par, cada par de sequências é disposto nesta matriz com uma sequência na primeira linha e a outra na primeira coluna.

Todos os pares possíveis de sequências são analisados na matriz de pontos, onde um ponto indica ____________ das duas sequências a serem alinhadas par a par.

Assinale a alternativa que complete corretamente a frase acima.