Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região ...

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Q568719 Biomedicina - Análises Clínicas
Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é: 

Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

A explicação mais provável é que: 
Alternativas

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O alinhamento das quatro sequências apresenta uma diferença na posição 9, em que as sequências 1, 3 e 4 apresentam um traço (-) e a sequência 2 apresenta um nucleotídeo (T). Essa diferença não é esperada, uma vez que todas as sequências deveriam conter o mesmo nucleotídeo na mesma posição, uma vez que são da mesma região codificadora da enzima em diferentes espécies de roedores. A explicação mais provável para essa discrepância é um erro na leitura do eletroferograma da espécie 2, o que sugere que a alternativa correta é a C. As outras alternativas não são plausíveis, uma vez que não explicariam essa diferença específica nas sequências.

A alternativa correta é a C: Ocorreu um erro na leitura do eletroferograma da espécie 2.

1. Análise do alinhamento:

  • As sequências 1, 3 e 4 são idênticas.
  • A sequência 2 difere das outras apenas na 9ª posição, onde há um "-" em vez de um "T".
  • Essa ausência de um nucleotídeo causa uma mudança no quadro de leitura a partir do 4º aminoácido, resultando em uma proteína completamente diferente.

2. Implicações da diferença:

  • A mudança no quadro de leitura gera uma proteína diferente, que não necessariamente é não funcional.
  • No entanto, a ausência de um nucleotídeo pode ter um impacto significativo na estrutura e função da proteína.
  • É possível que a proteína codificada pela sequência 2 seja truncada ou com aminoácidos incorretos, o que pode afetar sua função.

A. Espécie diferente:

  • É improvável que uma única mutação leve a uma espécie diferente.
  • As outras sequências idênticas sugerem um ancestral comum recente.

B. Contaminação:

  • A contaminação introduziria sequências aleatórias, não apenas uma mudança específica.
  • As outras sequências idênticas indicam um resultado confiável para essas espécies.

D. Dobra na proteína:

  • Mutações por dobra afetam regiões maiores do que um único aminoácido.
  • A mudança na 4ª posição não está em uma região propensa a dobras.

E. Pseudogene:

  • A ausência de um nucleotídeo não é uma característica típica de pseudogenes.
  • Pseudogenes geralmente apresentam mutações nonsense ou frameshift em todo o gene.

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