São desafios à EJA:

Atribuir novas atividades de integração para os educandos, que acabam dificultando sua permanência nos bancos escolares.

A manutenção da frequência às aulas por parte dos estudantes e a conseguinte continuidade de seus estudos.

Determinação de horários de estudo e de horas extras, nem sempre compatíveis com a vida social do educando.

A manutenção da frequência às atividades extraclasse por parte dos educandos e a continuidade de seus estudos na escola.

O estabelecimento de parcerias profissionais para a expansão da oferta de educação profissional inicial e continuada.