Transcriptomas podem ter uma alta complexidade e conter
centenas de milhares de mRNAs diferentes, em diferentes
proporções. Portanto, para caracterização do transcriptoma é
necessário identificar e, idealmente, determinar as
abundâncias relativas de cada transcrito.
Sobre as técnicas mais populares de análise de transcritoma,
assinale a alternativa incorreta.

Question

Transcriptomas podem ter uma alta complexidade e conter
centenas de milhares de mRNAs diferentes, em diferentes
proporções. Portanto, para caracterização do transcriptoma é
necessário identificar e, idealmente, determinar as
abundâncias relativas de cada transcrito.
Sobre as técnicas mais populares de análise de transcritoma,
assinale a alternativa incorreta.  Alternativa A: A análise serial da expressão gênica (SAGE) identifica
sequências pequenas de até 12pb. Ou Alternativa B: O SAGE utiliza de enzimas de restrição não usuais, que
não clivam o sítio de reconhecimento, mas uma em uma
região de 10 a 14 nucleotídeos a jusante. Ou Alternativa C: O SAGE, além de identificar individualmente mRNAs,
permite a informação exata da abundância destes RNAs. Ou Alternativa D: A técnica de microarranjos de DNA permite uma
comparação mais acurada que o SAGE da quantidade de
um determinado mRNA. Ou Alternativa E: Na técnica de microarranjos de DNA, marcadores
fluorescentes são utilizados e o sinal de hibridização
pode ser detectado por meio de microscopia confocal.

Drauzio Jr · Accepted Answer

Alternativa [C] O SAGE, além de identificar individualmente mRNAs,
permite a informação exata da abundância destes RNAs. A alternativa incorreta é a letra D. A técnica de microarranjos de DNA, também conhecida como microarrays, não permite uma comparação mais acurada que o SAGE da quantidade de um determinado mRNA. Na verdade, ambas as técnicas têm suas vantagens e desvantagens e são frequentemente utilizadas em conjunto para a análise de transcritoma. O SAGE é capaz de detectar transcritos raros, mas é menos sensível para detectar genes com baixa expressão, enquanto os microarrays são mais sensíveis para detectar genes com baixa expressão, mas podem não ser capazes de detectar transcritos raros. Além disso, os microarrays são limitados pelas sondas de DNA disponíveis, enquanto o SAGE pode identificar qualquer transcritoma presente.

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