Como os vírus se reproduzem dentro das células hospedeiras: 

A alternativa correta é C: Liberando seu material genético e comandando o metabolismo celular para produzir novos vírus.

Vamos entender detalhadamente por que esta é a opção correta e por que as outras não são.

Alternativa C - Liberando seu material genético e comandando o metabolismo celular para produzir novos vírus:

Os vírus são parasitas intracelulares obrigatórios, o que significa que eles só conseguem se reproduzir dentro de células hospedeiras. Quando um vírus infecta uma célula, ele injeta seu material genético (DNA ou RNA) na célula hospedeira. Esse material genético então assume o controle da maquinaria celular, redirecionando-a para que produza os componentes necessários para formar novos vírus. Eventualmente, esses novos vírus são montados e liberados da célula hospedeira, muitas vezes matando a célula no processo.

Agora vamos analisar por que as outras alternativas não estão corretas:

Alternativa A - Por meio de bipartição:

A bipartição, ou fissão binária, é um processo de reprodução comum em bactérias e alguns protozoários. Neste processo, a célula se divide em duas partes idênticas. No entanto, os vírus não possuem a capacidade de realizar bipartição, pois eles não são células completas e não têm a estrutura necessária para se dividirem dessa maneira.

Alternativa B - Produzindo novas células hospedeiras:

Os vírus não são capazes de produzir novas células hospedeiras. O que eles fazem é infectar células já existentes e utilizarem a maquinaria dessas células para se replicarem. A produção de novas células é uma característica de organismos mais complexos, como plantas e animais, e não de vírus.

Alternativa D - Por meio de flagelos ou cílios:

Flagelos e cílios são estruturas utilizadas por algumas células, como espermatozoides e certos protozoários, para locomoção. Os vírus não possuem essas estruturas, pois são muito simples em sua composição. Eles se movem e se espalham principalmente através de métodos passivos, como o ar, água ou fluidos corporais, e precisam de uma célula hospedeira para se reproduzirem.

Compreender essas diferenças é fundamental no estudo da biologia dos vírus e auxilia na resolução de questões como esta em concursos públicos. Espero que essa explicação tenha esclarecido o assunto para você!