Ao analisarmos o genoma de um organismo eucariótico, ...

A alternativa correta é a B: promotores, códon da metionina, janela aberta de leitura e códon stop.

Vamos discorrer sobre cada uma das alternativas para entender por que a alternativa B é a correta e por que as outras estão incorretas.

Alternativa A: sequência 3’ não traduzida, introns, alças não hibridadas e ilhas de CpG.

Esses elementos estão presentes no genoma, mas nem todos são diretamente envolvidos na identificação e quantificação dos genes propriamente ditos. A sequência 3' não traduzida e os introns são partes do mRNA e do DNA que não codificam proteínas, enquanto as alças não hibridadas não são diretamente relacionadas a genes. As ilhas de CpG estão relacionadas à regulação gênica e metilação do DNA, mas não são usadas para identificar genes.

Alternativa B: promotores, códon da metionina, janela aberta de leitura e códon stop.

Esses elementos são essenciais para a identificação de genes em um organismo eucariótico. Os promotores são sequências de DNA que iniciam a transcrição dos genes. O códon da metionina (AUG) é o início da tradução na síntese proteica. A janela aberta de leitura (ORF) é a sequência contínua de nucleotídeos que pode ser traduzida em uma proteína. O códon stop sinaliza o fim da tradução. Todos esses componentes são fundamentais para a identificação e quantificação de genes.

Alternativa C: microssatélites, sequências “enhancers”, telômeros e centrômeros.

Esses elementos são importantes na estrutura e regulação do DNA, mas não são diretamente utilizados na identificação de genes. Os microssatélites são repetições de sequências curtas de DNA, os enhancers são sequências que aumentam a atividade transcricional, os telômeros são as extremidades dos cromossomos, e os centrômeros são regiões que unem as cromátides irmãs. Nenhum desses elementos é diretamente usado para identificar e quantificar genes.

Alternativa D: nucleotídeos, cavidades maior e menor, cadeias antiparalelas e grampos.

Esses termos se referem à estrutura física do DNA. Nucleotídeos são os blocos de construção do DNA. As cavidades maior e menor são os sulcos do DNA. As cadeias antiparalelas referem-se à orientação oposta das fitas de DNA. Grampos geralmente se referem a estruturas de RNA. Embora importantes, eles não são usados especificamente para identificar genes.

Alternativa E: pareamento de Hoogsteen, palíndromos, hélices duplas e O⁶-metilguanina.

Esses termos são mais específicos da estrutura e modificação do DNA. Pareamento de Hoogsteen é um tipo alternativo de pareamento de bases. Palíndromos são sequências que se lêem da mesma forma em ambas as direções. Hélices duplas descrevem a estrutura do DNA. O⁶-metilguanina é uma base modificada. Estes elementos também não são utilizados diretamente para identificar genes.

Portanto, a alternativa B é a correta porque contém elementos diretamente envolvidos na transcrição e tradução dos genes, fundamentais para a identificação e quantificação dos genes em um genoma eucariótico.

Os promotores gênicos estão localizados antes do  do gene (na extremidade 5’) e participam promovendo a transcrição de uma sequência de DNA em RNA. Além disso eles estão diretamente ligados à quantidade de cópias de RNA que será transcrita a partir de uma mesma sequência de DNA. Eles são o “botão liga/desliga” de um gene, com a diferença de que podem estar ligados com uma força maior ou menor. Cada promotor acaba interagindo com um conjunto de proteínas que influenciam na sua atividade.

Já os terminadores gênicos estão localizados logo após o , também conhecido como stop-codon, (na extremidade 3’) e realizam outras diferentes funções. Por sua vez, eles estão envolvidos com o término da transcrição e com a adição da famosa “” presente no RNA mensageiro de eucariotos e procariotos, que influencia diretamente na durabilidade desse mesmo RNA no citoplasma celular.

Figura 1: Regiões gênicas. O promotor está localizado antes do códon de início e o terminador logo após o códon de parada.

fonte:

https://www.blogs.unicamp.br/tb-of-life/2016/07/04/onde-bioinformatica-promotores-e-terminadores-se-encontram/