São diversas as técnicas para os estudos de expressão gênica...

Microarranjo de DNA: método de sequenciamento de cDNA de alto desempenho baseado no sequenciamento de transcritos.

Bibliotecas de EST: é o método de sequenciamento de cDNA de alto desempenho, baseado no sequenciamento direto de transcritos.

RNA – seq: são sequências ou etiquetas (tags) de leitura simples produzidas a partir do sequenciamento parcial de uma biblioteca de cDNA.

Análise serial da expressão gênica (SAGE): consiste em um arranjo de moléculas de DNA de fita simples, denominadas sondas, quimicamente ligadas a uma superfície sólida, os “chips”.

Hibridização subtrativa supressiva (SSH): consiste na hidrização de uma amostra de cDNA de interesse (tester) com um excesso de cDNA fita simples de outra amostra contrastante (driver).