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Cílios e flagelos são estruturas microtubulares que se projetam para o meio extracelular de certas células de invertebrados, de protistas e de organismos superiores. Originam-se do alongamento de nove microtúbulos dos centríolos. É comum fazer-se a distinção entre cílios e flagelos pelo número e pela dimensão dos mesmos. Os cílios são curtos e numerosos, enquanto os flagelos são longos e em pequeno número. Ambos possuem participação nos movimentos celulares. Ex.: protozoários ciliados (paramecium), espermatozóides, bactérias etc.