Não se compreende se o que acaba do dia é conosco que finda...

Não se compreende se o que acaba do dia...

Não É compreendido ISSO (se o que acaba do dia...)

PA e conjunto integrante.

Não é compreendido isso 

Quem não Compreende, não compreende alguma coisa... Logo, o verbo é transitivo direto. A partícula apassivadora está ligada a Verbos Transitivos diretos e verbos transitivos diretos e indiretos (VTD e VTDI).

Portanto, o primeiro SE é uma partícula apassivadora...

No segundo caso podemos matar a questão com o seguinte macete... Não se compreende ISSO, esse "SE" é uma conjunção integrante.

não é compreendido

isso

"Não se compreende se o que acaba do dia é conosco que finda em mágoa inútil, ou se o que somos é falso entre penumbras."

No primeiro caso, temos um pronome apassivador, pois está ligado a um VTD.

No segundo caso, estamos diante de uma conjunção integrante, já que podemos substituir o "se" por "isso".

Gabarito B