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Espessamento da mucosa e lâmina própria do íleo, ceco e cólon espessada e rugosa, e ulcerações. Edema, hiperemia e hemorragia na mucosa igualmente puderam ser vistas naqueles segmentos, além de linfonodos regionais aumentados de volume. À microscopia ótica, foram encontrados: intensa infiltração inflamatória mononuclear (macrófagos, células epitelioides ou gigantes, linfócitos, plasmócitos) e, mais raramente, alguns granulócitos, neutrófilos e eosinófilos. Organismos álcool-ácido resistentes foram encontrados no interior dos macrófagos.
O diagnóstico é enterite granulomatosa, relacionada à: