Questões de Concurso Público INCA 2010 para Tecnologista Júnior – Bioinformática
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A bioinformática pode ser definida como uma área multidisciplinar que envolve principalmente a Biologia, a Ciência da Computação, a Matemática e a Estatística.
O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a análise dos genes que compõem o DNA humano. Concluído em 2001, esse projeto contou com o apoio decisivo da bioinformática.
A biologia computacional é um campo de pesquisa muito próximo ao da bioinformática
Enquanto a biologia computacional geralmente trata de ferramentas para organização e recuperação de informações biológicas, a bioinformática geralmente está relacionada ao desenvolvimento de algoritmos
Dayhoff, Waterman e Altschul são pesquisadores de relevante importância para o desenvolvimento da bioinformática
O formato FASTA é composto por uma linha de comentário iniciada por “>”; pela sequência biológica; e por um "*" opcional, que marca o final da sequência.
O MSS (multiple sequence standard) é um formato comum para alinhamentos múltiplos de sequências.
O AceDB foi um dos primeiros bancos de dados genômicos.
O NCBI (National Center for Biotechnology Information) mantém o GenBank, que é uma coleção anotada de sequências de DNA disponíveis publicamente.
A base de dados nr é mantida pelo NCBI, e sua sigla significa new and representative.
O DDBJ, o EMBL e o GenBank são os mais importantes bancos de dados públicos de informação genômica e são sincronizados diariamente.
O objetivo principal da comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade.
O algoritmo de Smith-Waterman permite encontrar o alinhamento ótimo entre duas sequências, porém, devido à sua complexidade exponencial de tempo, sua execução é muito demorada.
O BLAST é executado em duas grandes fases: semeadura (seeding) e extensão
O programa ssearch permite implementar uma variação do BLAST.
O BLAST é um conjunto de programas que podem ser executados via sítio do NCBI.
O alinhamento múltiplo de sequências consiste no alinhamento de mais de duas sequências.
O alinhamento múltiplo de sequências é bastante utilizado para obtenção das estruturas terciárias das proteínas que compõem o mesmo.
O CLUSTALW é uma das ferramentas heurísticas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências.
O HMMER usa modelos coloridos de Markov para alinhar uma sequência de aminoácidos com um determinado perfil (profile).