Questões de Concurso Público INCA 2010 para Tecnologista Júnior – Bioinformática
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O DDBJ, o EMBL e o GenBank são os mais importantes bancos de dados públicos de informação genômica e são sincronizados diariamente.
O objetivo principal da comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade.
O algoritmo de Smith-Waterman permite encontrar o alinhamento ótimo entre duas sequências, porém, devido à sua complexidade exponencial de tempo, sua execução é muito demorada.
O BLAST é executado em duas grandes fases: semeadura (seeding) e extensão
O programa ssearch permite implementar uma variação do BLAST.