Questões FIOCRUZ 2010 para Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA

Q568722

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568722 Biomedicina - Análises Clínicas

Sobre alinhamentos de sequências de DNA, é correto afirmar que:

A

apenas no alinhamento par a par, a homologia é garantida.

B

todos algoritmos de alinhamento buscam maximizar a homologia entre as sequências.

C

o alinhamento múltiplo garante a paralogia, mas não a ortologia das sequências.

D

o alinhamento par a par garante a paralogia, mas não a ortologia das sequências.

E

a paralogia é homologia de genes duplicados.

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Q568723

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568723 Biomedicina - Análises Clínicas

A enzima DNA polimerase é responsável pela replicação do DNA, no entanto ela não atua sozinha durante este processo. Assinale abaixo a afirmativa que indica um componente que não atua na replicação do DNA.

A

A enzima primase.

B

A enzima helicase.

C

A enzima girase.

D

As proteínas de ligação ao DNA unifilamentar.

E

A enzima RNA polimerase II.

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Q568724

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568724 Biomedicina - Análises Clínicas

Plasmídeos são moléculas circulares de DNA encontrados em bactérias. Elas são utilizados como vetores para a clonagem de genes e portanto fundamentais para o estudo de genes.

Sobre as características típicas encontradas em plasmídeos utilizados para clonagem, assinale a alternativa incorreta.

A

O plasmídeo precisa ter um marcador de seleção que confere resistência a bactéria a um antibiótico específico.

B

O plasmídeo precisa ter uma origem de replicação, que permite a multiplicação independente do DNA bacteriano.

C

O plasmídeo usualmente tem sítio múltiplo de clonagem que permite a utilização de várias enzimas de restrição durante a clonagem.

D

O plasmídeo precisa ter mais de 10.000 pb de forma que seja estável na bactéria.

E

O plasmídeo usualmente tem um sítio para anelamento de iniciadores de PCR para sequenciamento M13 próximos a sítio de inserção.

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Q568725

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568725 Biomedicina - Análises Clínicas

Uma série de técnicas são usualmente utilizadas para estudo da expressão de genes. Sobre técnicas de análise da expressão gênica, assinale a alternativa incorreta.

A

O Northern blot é uma técnica de avaliação da expressão gênica que apresenta tipicamente uma alta sensibilidade e necessita de pequenas quantidades de material biológico, quando comparada a outras técnicas como o RT-PCR.

B

O RT-PCR é uma técnica para avaliação da expressão gênica que depende de uma etapa de síntese de cDNA.

C

A técnica de RT-PCR em tempo real é mais acurada para a avaliação da expressão gênica quando comparada a outras técnicas como o RT-PCR.

D

O hibridização in situ de mRNA permite identificar a localização espacial da expressão gênica em um determinado tecido ou órgão.

E

Para a realização da hibridização in situ, a preparação do tecido ou órgão do organismo em questão deve proteger o mRNA da degradação e também preservar as estruturas celulares.

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Q568726

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568726 Biomedicina - Análises Clínicas

Uma forma de amplificar um fragmento de DNA é a clonagem em plasmídeo e a transformação de uma cepa bacteriana para posterior extração do DNA plasmidial. A classificação mais utilizada para plasmídeos é a baseada em características do DNA.

Sobre os cinco principais tipos de plasmídeos, assinale a alternativa incorreta.

A

Plasmídeos de resistência – Carregam genes que conferem à bactéria hospedeira resistência a um ou mais agentes antibacteriano como, por exemplo, o da ampicilina.

B

Plasmídeos de virulência – Conferem patogenicidade à bactéria hospedeira.

C

Plasmídeos de fertilidade (F) – Possuem a característica de promover a transferência de plasmídeos.

D

Plasmídeos degradativos – Carregam genes que permitem a bactéria hospedeira a metabolizar moléculas não usualmente metabolizadas.

E

Plasmídeos Col – Carregam genes para as colicinas, proteínas que promovem o crescimento bacteriano.

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Q568727

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568727 Biomedicina - Análises Clínicas

Transcriptomas podem ter uma alta complexidade e conter centenas de milhares de mRNAs diferentes, em diferentes proporções. Portanto, para caracterização do transcriptoma é necessário identificar e, idealmente, determinar as abundâncias relativas de cada transcrito.

Sobre as técnicas mais populares de análise de transcritoma, assinale a alternativa incorreta.

A

A análise serial da expressão gênica (SAGE) identifica sequências pequenas de até 12pb.

B

O SAGE utiliza de enzimas de restrição não usuais, que não clivam o sítio de reconhecimento, mas uma em uma região de 10 a 14 nucleotídeos a jusante.

C

O SAGE, além de identificar individualmente mRNAs, permite a informação exata da abundância destes RNAs.

D

A técnica de microarranjos de DNA permite uma comparação mais acurada que o SAGE da quantidade de um determinado mRNA.

E

Na técnica de microarranjos de DNA, marcadores fluorescentes são utilizados e o sinal de hibridização pode ser detectado por meio de microscopia confocal.

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Q568728

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568728 Biomedicina - Análises Clínicas

Dentre as técnicas a seguir, assinale a que não é considerada uma técnica de genômica funcional.

A

Microarranjos de DNA.

B

Hibridização in situ.

C

Estudo da interação gênica por análise supressor em larga escala.

D

Perturbação gênica ou nocaute gênico em larga escala.

E

Estudo da interação gênica pelo sistema duplo híbrido em larga escala.

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Q568729

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568729 Biologia

Um dos pontos mais importantes na reação de PCR é a razão ótima entre iniciadores e DNA molde.

Sobre esse tema, assinale a afirmativa incorreta.

A

Caso a razão oligo/DNA molde seja alta, ocorrerá a formação de dímeros de oligos.

B

A complexidade do DNA molde usado na reação não é um fator que interfere na razão oligo/DNA molde.

C

Caso a razão oligo/DNA molde seja baixa, o produto do PCR não será acumulado exponencialmente.

D

Uma razão oligo/DNA molde baixa resulta na renaturação da fitas recém sintetizadas, após a desnaturação, levando a baixa eficiência da reação.

E

Para a maioria dos casos, a concentração de iniciador não deve ser muito maior que 0,5 μM.

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Q568730

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568730 Biomedicina - Análises Clínicas

Dentre as sentenças abaixo, selecione aquela que descreve uma etapa não presente no procedimento de uma reação de PCR padrão.

A

Resfriamento da amostra a 16 °C por 30 segundos a cada ciclo.

B

Anelamento dos iniciadores no DNA alvo a 55 °C por um minuto a cada ciclo.

C

Desnaturação da amostra a 95 °C por 40 segundos a cada ciclo.

D

Alongamento/Polimerização a 72 °C por um minuto a cada ciclo.

E

Desnaturação inicial da amostra a 95°C por cinco minutos.

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Q568731

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568731 Biomedicina - Análises Clínicas

Para o desenho do iniciadores ou oligonucleotídeos para reação de PCR, algumas orientações precisam ser seguidas de forma a garantir o sucesso da amplificação.

Selecione dentre as sentenças abaixo aquela que corresponde a uma orientação errada.

A

Os iniciadores devem ter entre 18 e 22 nucleotídeos.

B

A temperatura de desnaturação dos iniciadores deve estar entre 52 e 58 °C salvo em reações de PCR não usuais.

C

O conteúdo de CG (número total de Guaninas e Citosinas no iniciador em relação ao número total de bases) deve estar entre 40 e 60%.

D

Mais de três guaninas ou citosinas devem ser preferencialmente colocadas nos últimos cinco nucleotídeos da ponta 3' dos iniciadores.

E

Regiões de complementaridade entre os dois iniciadores de uma reação de PCR devem ser evitadas.

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Q568732

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568732 Biomedicina - Análises Clínicas

O PCR quantitativo pode ser utilizado para avaliar o nível de expressão de um determinado gene. No entanto, este ensaio apresenta um problema frequente que pode distorcer os resultados, a avaliação da amplificação de uma amostra que não está mais na fase exponencial de amplificação.

Assinale a alternativa com a melhor opção para resolver esse problema.

A

Otimizar as concentrações de iniciadores da reação de PCR quantitativo.

B

Otimizar a concentração de fita molde inicial.

C

Otimizar o número de ciclos de amplificação.

D

Otimizar a temperatura de anelamento dos iniciadores.

E

Otimizar a temperatura de alongamento/polimerização da Taq polimerase.

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Q568733

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568733 Biomedicina - Análises Clínicas

A alternativa que melhor define um gene de referência ou gene normalizador em um PCR quantitativo para avaliação da expressão é um gene:

A

muito expresso.

B

pouco expresso.

C

com expressão conspícua em todas as células.

D

com expressão em uma situação particular fisiológica.

E

não expresso.

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Q568734

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568734 Biomedicina - Análises Clínicas

Sobre as diferenças entre o método didesoxi e o método de utilizado em sequenciadores automáticos, assinale a alternativa incorreta.

A

O método didesoxi é usualmente dependente de radioatividade, enquanto o dos sequenciadores automáticos utiliza corantes fluorescentes.

B

No método didesoxi são necessárias quatro reações distintas para uma mesma sequência, enquanto que nos sequenciadores automáticos apenas uma reação é utilizada.

C

A interpretação do resultado do método didesoxi depende da revelação de um autoradiagrama, enquanto nos sequenciadores automáticos o resultado é revelado em tempo real em um gráfico.

D

O método didesoxi depende da migração em gel de poliacrilamida, enquanto que nos sequenciadores automáticos outra matrizes de migração podem ser utilizadas.

E

O método didesoxi depende de uma reação de PCR para obtenção dos resultados, enquanto nos sequenciadores automáticos o PCR não é necessário.

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Q568735

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568735 Biomedicina - Análises Clínicas

Os métodos de normalização são fundamentais para um experimento bem sucedido de microarranjos de DNA. Estes métodos são necessários para corrigir uma série de variáveis intrínsecas do experimento.

Dentre as afirmativas a seguir, assinale a que não corresponde a uma variável presente em um experimento de microarranjos de DNA.

A

Eficiência de hibridização.

B

Sensibilidade da medida do sinal.

C

Número de células na amostra.

D

Quantidade de elementos impressos no microarranjo.

E

Eficiência do isolamento do RNA total.

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Q568736

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568736 Biomedicina - Análises Clínicas

O principal problema na extração de RNA é a presença da enzima RNAse, responsável pela degradação do RNA. Esta enzima, na maioria das vezes, é derivada do próprio tecido de onde se objetiva a extração de RNA, mas também pode ser resultado de uma contaminação externa.

Selecione a alternativa que descreve uma forma ineficaz de proteção do RNA da ação das RNAses durante a extração.

A

Utilizar proteínas que podem ser obtidas de empresas de biologia molecular que impedem a ação das RNAse por inibir a função catalítica destas enzimas.

B

Aquecer as amostras biológicas antes da extração por 10 minutos a 80°C.

C

Utilizar dietil pirocarbonato (diethyl pyrocarbonate – DEPC) nas soluções preparadas para a extração de RNA.

D

Expor a vidraria a ser utilizada durante a extração a temperaturas de 200°C por três a quatro horas.

E

Trabalhar sempre com luvas, durante a manipulação das amostras.

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Q568737

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568737 Biomedicina - Análises Clínicas

Microarranjos de DNA produzidos pela técnica de síntese in situ tem se tornado cada vez mais comum. Sobre a técnica de síntese in situ, analise as afirmativas a seguir.

I. No método piesoelétrico, quantidades mínimas de líquido da ordem de picolitros, são depositadas na superfície. No entanto, a uniformidade do elemento é de pior qualidade do que os métodos usuais baseados em deposição por pinos metálicos.

II. A produção de microarranjos de DNA por fotolitografia é o método usualmente utilizado pela empresa Affymetrix.

III. O método piesoelétrico não permite a impressão direta em lâminas de vidro de oligonucleotídeos de até 60 nucleotídeos.

Assinale:

A

se todas as afirmativas estiverem corretas.

B

se apenas a afirmativa II estiver correta.

C

se apenas as afirmativas II e III estiverem corretas.

D

se apenas a afirmativa III estiver correta.

E

se apenas as afirmativas I e III estiverem corretas.

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Q568738

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568738 Biomedicina - Análises Clínicas

O método de microarranjo por deposição de DNA pré-sintetizado é considerado de mais fácil implementação por instituições sem fins lucrativos como institutos de pesquisa ou universidades.

Sobre o método, assinale a afirmativa incorreta.

A

O método de microarranjo por deposição de DNA pré-sintetizado em uma superfície sólida foi desenvolvido acerca de 33 anos atrás e popularizado na década de 90.

B

O método de microarranjo por deposição de DNA pré-sintetizado depende da utilização de um robô que é responsável pelo gotejamento das amostras.

C

Para a impressão do DNA pré-sintetizado, é necessária a preparação da lâmina com a cobertura de poli-lisina ou poli-amina.

D

O DNA a ser impresso no microrranjo pode ser fragmentos de DNA ou oligonucleotídeos de 60 a 75 nucleotídeos.

E

A densidade de elementos por área impressa que pode ser obtida pelo método de microarranjo por deposição de DNA pré-sintetizado é superior ao obtido pelo método fotolitografia.

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Q568739

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568739 Biomedicina - Análises Clínicas

Para a extração de RNA/DNA, uma das etapas mais importante é a eliminação das proteínas durante o processo de purificação. Para a eliminação de proteínas na extração de RNA/DNA, assinale a afirmativa inadequada.

A

Digestão das amostras com a enzima proteinase K.

B

Extrações com misturas de solventes orgânicos como fenol e clorofórmio por repetidas vezes.

C

Solubilização em tampões de guanidina.

D

Precipitação salina.

E

Solubilização em tampões ácidos (pH menor que 3,5).

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Q568740

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568740 Biomedicina - Análises Clínicas

Recentemente, a tecnologia do RNA-sequencing (RNA-seq) vem sendo considerada como uma alternativa ao microarranjo de DNA para estudo da expressão gênica. Sobre as vantagens do RNA-seq quando comparado ao microarranjo de DNA, assinale a afirmativa incorreta.

A

A única tecnologia de sequenciamento high-throughput habilitada para realizar RNA-seq é a Roche 454 life Science.

B

O RNA-seq não é restrito ao estudo de organismos que possuem o genoma sequenciado como microarranjo de DNA.

C

O RNA-seq é mais atraente do que o microarranjo de DNA para organismos não-modelo.

D

O RNA-seq pode revelar informações como junção exon-exon, o que não ocorre no microarranjo de DNA.

E

O RNA-seq pode revelar variações (como SNPs) em regiões transcritas o que não ocorre no microarranjo de DNA.

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Q568741

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568741 Biomedicina - Análises Clínicas

A tecnologia de sequenciamento da Illumina ® é considera uma das principais formas de sequenciamento de última geração.

Sobre a tecnologia Illumina®, assinale a afirmativa incorreta.

A

Na preparação do DNA para o sequenciamento, é desnecessária a ligação de adaptadores de DNA.

B

Na etapa inicial, as fitas simples de DNA se ligam randomicamente a superfície.

C

Para a amplificação, a enzima incorpora nucleotídeos para produzir uma dupla fita em ponte que realizada em um substrato sólido.

D

A etapa de desnaturação da dupla fita produzida deixa as fitas simples ancoradas no substrato.

E

A etapa de amplificação termina quando são formados milhões de agrupamentos de fita duplas de DNA com alta densidade no substrato sólido.

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Questões de Concurso Público FIOCRUZ 2010 para Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA

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