Questões de Concurso Sobre biologia molecular em biomedicina em biomedicina - análises clínicas

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Q568589 Biomedicina - Análises Clínicas
Dentre as novas e eficazes técnicas de detecção molecular de Mycobacterium tuberculosis, a metodologia denominada Gene XPert (Cepheid) apresenta os aspectos mais promissores, especialmente devido a redução do tempo de detecção do patógeno, inclusive da resistência a rifampicina. Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. O método XPert MTB/RIF consiste em um método automatizado utilizando um ensaio baseado em reação de polimerização em cadeia baseado em hemi-nested real time para amplificação parcial do gene rpoB e hibridação.

II. O teste é realizado em até duas horas, utilizando uma plataforma XPert MTB/RIF com integração do processamento do espécime e PCR em um único recipiente, contendo todos os reagentes para amplificação e detecção do produto amplificado.

III. O método exige a realização de etapas de lise bacteriana e extração do DNA por meio de protocolo simplificado anterior à utilização do cartucho para amplificação e detecção do produto amplificado.

Assinale: 

Alternativas
Q568571 Biomedicina - Análises Clínicas
Devido ao crescimento lento de algumas micobactérias, metodologias moleculares rápidas com sequenciamento de genes consistem em procedimentos adequados de aplicação em laboratórios de referência e de rotina visando a identificação de micobactérias. Sobre a aplicabilidade da técnica para a identificação de micobactérias, analise as afirmativas a seguir.

 I. Os pares M. kansasii e M. gastri, M. ulcerans e M. marinum, M. shimoidei e M. triviale, e M. abscessus e M. chelonae não podem ser diferenciados por sequências do gene rrs.

II. Em cepas cultivadas em meio sólido, a extração de DNA e a reação de polimerização em cadeia, para posterior sequenciamento gênico, apresentam resultados reprodutíveis e de precisão superior àqueles realizados a partir de cepas cultivadas em meio líquido. 

III. Para a identificação de espécies de micobactérias não tuberculosas de crescimento rápido, os alvos incluem os genes dnaJ, hsp65, gyrB, 16S rDNA, secA1, sod ou a sequência ITS 16S-23S.

Assinale: 


Alternativas
Q568570 Biomedicina - Análises Clínicas
Em 1993, Telenti e colaboradores propuseram um método para identificação molecular rápida de micobactérias com a restrição por endonucleases de uma sequência parcial do gene hsp65, seguida da análise do polimorfismo dos fragmentos resultantes, denominada PRA-hsp65. Considerando conceitos e aspectos técnicos da metodologia citada, assinale a alternativa incorreta.
Alternativas
Q568568 Biomedicina - Análises Clínicas
Vários sistemas foram descritos para identificação genotípica de cepas micobacterianas isoladas de espécimes clínicos, incluindo as diferentes espécies do complexo M. tuberculosis. Sobre os princípios e as aplicações dos sistemas para a identificação de micobactérias, analise as afirmativas a seguir.

I. As técnicas baseadas apenas em reação de polimerização em cadeia com iniciadores específicos para as deleções genômicas RD de M. tuberculosis como RD1, RD4, RD9, RD12, discriminam as espécies M. tuberculosis e M. bovis (incluindo a espécie M. bovis BCG) bem como outras espécies do complexo.

II. Espécies do complexo M. tuberculosis podem ser diferenciadas pelo teste AccuProbe (GenProbe Inc., San Diego, California, EUA), que consiste em sondas marcadas com éster de acridina. Esse mesmo sistema pode também ser aplicado na identificação de cepas do complexo M. avium e M. kansasii.

III. Os sistemas INNO-LiPA Mycobacteria version 2 (Innogenetics, Ghent, Bélgica) GenoType Mycobacteria (Hain Lifescience, Nehren, Alemanha) consistem em hibridização reversa de produtos de reação de polimerização em cadeia biotinilados aos seus fragmentos complementares presentes em “tiras" de membrana. Ambos permitem a identificação molecular de acima de 10 espécies de micobactérias. Uma desvantagem do sistema é a impossibilidade de uso em cepas cultivadas em meios líquidos.

Assinale:

Alternativas
Q568566 Biomedicina - Análises Clínicas
De maneira semelhante ao ocorrido recentemente com outros grupos bacterianos, o número de espécies novas descritas para as micobactérias de crescimento rápido (MCR) tem aumentado significativamente nas últimas décadas, dificultando uma classificação confiável em laboratórios de rotina. Em alguns casos, as novas espécies foram propostas com base um único isolamento ou em um número pequeno de cepas isoladas. Sobre os aspectos taxonômicos recentes de MCRs, analise as afirmativas a seguir.

I. Os estudos taxonômicos envolvendo a filogenia entre membros de MCR têm sido baseados na análise de sequências dos genes 16S rRNA, 23S rRNA, hsp65 e aquele codificante para RNA polimerase.

II. A técnica de hibridização DNA-DNA consiste na metodologia de maior acurácia na determinação de espécies de MCRs, apesar de ser laboriosa e atualmente realizada em centros de referência internacionais, justificando a busca de alternativas por diferentes laboratórios de pesquisa.

III. Os complexos taxonômicos descritos para MCRs consistem em (i) Grupo M. fortuitum, composto por M. fortuitum, M. peregrinum, M. mucogenicum e M. senegalense; (ii) Grupo M. chelonae-M. abscessus, composto pelas espécies M. chelonae, M. abscessus, M. bolletii, M. massiliense e M. immunogenum; e (iii) Grupo M. smegmatis, constituído por M. smegmatis, M. goodii e M. wolinskyi.

Assinale: 


Alternativas
Q568564 Biomedicina - Análises Clínicas
O arranjo taxonômico mais recente, e aceito por muitos autores, das micobactérias segue as propostas iniciais do International Working Group on Mycobacterial Taxonomy (IWGMT). As propostas incluíam estudos polifásicos com diferentes propriedades biológicas das espécies tais como caracterizações quimiotaxonômica e filogenética. Sobre os bacilos micobacterianos de crescimento lento potencialmente patogênicos, de uma das categorias sugeridas pelo IWGMT, analise as afirmativas a seguir.

I. O complexo M. avium–intracellulare inclui M. avium subsp. avium, M. avium subsp. paratuberculosis (Map), M. avium subsp. silvaticum, e M. intracellulare, que constituem o grupo III de Timpe & Runyon (1954) e são distribuídas em “serovares". Tais espécies (ou subespécies) são consideradas patógenos potenciais em seres humanos, algumas patógenos obrigatórios como M. avium subsp. silvaticum.

II. A espécie M. kansasii consiste em um dos três principais patógenos micobacterianos de crescimento lento frequentemente isolados de pacientes imunocompetentes ou imunocomprometidos com doença pulmonar no mundo. A espécie pode ser subdividida em cinco genótipos baseados em técnicas moleculares de análise de fragmentos após restrição enzimática e hibridização com sondas IS1652. Estudos filogenéticos indicam maior homologia (similaridade) com dessa espécie com M. gastri.

III. Dentre bacilos micobacterianos não pertencentes ao complexo M. tuberculosis e não patogênicos, estão M. genavense, M. haemophilum, M. malmoense, M. marinum e M. simiae.

Assinale: 

Alternativas
Q568561 Biomedicina - Análises Clínicas
Durante os estágios iniciais de um processo infeccioso, as bactérias precisam expressar adesinas permitindo a ligação às células do hospedeiro. Após essas etapas, a expressão de exotoxinas e fatores de evasão precisa ser regulada positivamente, com concomitante repressão dos fatores de colonização. A regulação da expressão de fatores de virulência pode ser controlada por diferentes mecanismos, por exemplo, sistemas de transdução de sinal de dois componentes. São exemplos desses sistemas, exceto:
Alternativas
Q568557 Biomedicina - Análises Clínicas
O agrupamento de genes que codificam proteínas com funções relacionadas constitui-se em uma unidade transcricional denominada:
Alternativas
Q568548 Biomedicina - Análises Clínicas
A análise das seqüências integrais de cromossomos bacterianos permitiu a constatação de que a maioria, se não todos, são estruturas em mosaico, compreendendo genes conservados além de múltiplas seqüências inseridas de diferentes origens. São exemplos dessas seqüências, exceto:
Alternativas
Q568441 Biomedicina - Análises Clínicas
A hibridação in situ cromogênica pode ser utilizada para detectar HPV (papilomavirus humano), vírus herpes simples tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2) e outros patógenos virais em biópsias. Com relação a esta técnica, assinale a afirmativa correta.
Alternativas
Q568439 Biomedicina - Análises Clínicas
                                               Baseado na figura responda à questão 

A figura abaixo representa sequências de ácidos nucléicos para técnica de hibridização in situ para diagnóstico molecular.

                         
A técnica de hibridização in situ pode utilizar diversas estratégias de acordo com seu propósito. Sendo assim, assinale a afirmativa correta:
Alternativas
Q568438 Biomedicina - Análises Clínicas
                                               Baseado na figura responda à questão 

A figura abaixo representa sequências de ácidos nucléicos para técnica de hibridização in situ para diagnóstico molecular.

                         
A detecção de ácidos nucléicos derivados de vírus ou bactérias pode ser essencial para o diagnóstico de uma doença. Sendo assim, assinale a afirmativa correta.
Alternativas
Q568437 Biomedicina - Análises Clínicas
                                             

Peptídeo ácido nucléico (PNA – peptide nucleic acid) é um polímero sintético artificial similar ao ADN e ao ARN em que o esqueleto de desoxiriboses-fosfato (ADN) ou riboses-fosfato (ARN) conectadas por ligações fosfo-diéster, é substituído por um esqueleto composto por N-(2-aminoetil)-glicinas conectadas por ligações peptídicas. O PNA vem sendo utilizado com cada vez mais frequência em experimentos de hibridação in situ em virtude de suas propriedades físico-químicas características. A tabela acima exibe a Tm, medida experimentalmente, de híbridos de octâmeros com a sequência 5'-TCTA TCTA TCTA TCTA-3' em pareamento do tipo Watson-Crick.
Assinale a afirmativa correta.
Alternativas
Q568436 Biomedicina - Análises Clínicas
                     Imagem associada para resolução da questão 

A figura acima é o resultado de uma hibridação in situ fluorescente (FISH) para detectar a presença de bacilos de Helicobacter pylori em uma amostra de biópsia gástrica.

Com relação ao tema, assinale a afirmativa correta.
Alternativas
Q568189 Biomedicina - Análises Clínicas
Com relação aos processos de implementação de uma bioteca ou um banco de tecidos e gerenciamento dos bancos de dados, analise as afirmativas a seguir.

I. Para a criação de banco de tecidos ou de células é importante o estabelecimento de um banco de dados que inclui as seguintes informações: tipo de tecido, pesquisador responsável, características do doador, informações da amostra (tipo da amostra ou célula, qualidade da amostra), informação da método de criopreservação escrito nos tubos dos tecidos (meio crioprotetor), condições de qualidade da estocagem como temperatura de freezers e manutenção.

II. Permitir acessibilidade por internet por meio de um inventário para outros departamentos e institutos de pesquisa de forma a tornar o inventário público com programas de computador de fácil acesso para pessoas com diferentes níveis educacionais, variando de pesquisadores de área básica, médicos e técnicos de laboratórios.

III. Classificação do tecido por patologistas especializados segundo os seguintes critérios: tecido normal não relacionado com doença (anotar qualquer condição médica associada), tecidos provenientes de pacientes com doenças não tumorais (especificar classificação de doença seguindo normas estabelecidas), pacientes com doenças tumorais (classificar quanto a malignidade: como hiperplasia, metaplasia, benigna ou maligna), além de nenhuma destas categorias citadas anteriormente. O tipo de tecido e sítios anatômicos de coleta (fluidos, posição de coleta) também deve constar no banco de dados.

Assinale:
Alternativas
Q568038 Biomedicina - Análises Clínicas
Sobre a técnica de PCR em Tempo Real, assinale a afirmativa incorreta.
Alternativas
Q568037 Biomedicina - Análises Clínicas
Sobre a utilização da técnica de PCR com a finalidade de diagnóstico molecular, analise as afirmativas a seguir.

I. Uma vez que na reação de PCR se utiliza uma DNA Polimerase dependente de DNA, somente os vírus cujo genoma é constituído por DNA podem ser detectados pela técnica de PCR.

II. É possível detectar microorganismos diferentes em uma mesma reação de PCR, desde que se utilize na reação pares de iniciadores específicos para cada microorganismo que se queira detectar.

III. A utilização da técnica de PCR para diagnóstico molecular terá sempre e somente caráter qualitativo.

Assinale: 
Alternativas
Q568036 Biomedicina - Análises Clínicas
Para a realização de PCR diagnóstico, utiliza-se frequentemente iniciadores degenerados ou contendo inosina como base nitrogenada a fim de maximizar a chance de detecção em amostras clínicas do ácido nucléico de patógenos que apresentem alta taxa de polimorfismos. Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. Iniciadores degenerados são misturas de oligonucleotídeos apresentando diferenças nos nucleotídeos em várias posições.

II. A inosina é uma base que pareia somente com adenina e timina.

III. Não é possível sintetizar iniciadores degenerados e que, ao mesmo tempo, contenham inosina.

Assinale: 
Alternativas
Q568035 Biomedicina - Análises Clínicas
O estabelecimento de uma reação de PCR para o diagnóstico molecular de agentes infecciosos a partir de amostras biológicas muitas vezes apresenta como maior dificuldade a amplificação específica do fragmento genômico do patógeno de interesse. As afirmativas a seguir enumeram possibilidades para aumentar a especificidade da reação.

I. Aumento da concentração de deoxinucleotídeo na reação de PCR.

II. Aumento da concentração da DNA polimerase na reação de PCR.

III. Realização de reações de PCR aninhadas (PCR-nested), utilizando par de iniciadores mais externos à região de interesse na primeira reação, seguido da utilização de par de iniciadores mais internos.

Assinale: 
Alternativas
Q568031 Biomedicina - Análises Clínicas
Os seguintes componentes essenciais são requeridos em uma reação de PCR, exceto:
Alternativas
Respostas
261: A
262: B
263: D
264: A
265: E
266: C
267: C
268: E
269: C
270: E
271: A
272: C
273: B
274: C
275: E
276: E
277: B
278: A
279: C
280: E