Questões de Biomedicina - Análises Clínicas - Biologia Molecular em Biomedicina para Concurso - Página 12

Q568736

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568736 Biomedicina - Análises Clínicas

O principal problema na extração de RNA é a presença da enzima RNAse, responsável pela degradação do RNA. Esta enzima, na maioria das vezes, é derivada do próprio tecido de onde se objetiva a extração de RNA, mas também pode ser resultado de uma contaminação externa.

Selecione a alternativa que descreve uma forma ineficaz de proteção do RNA da ação das RNAses durante a extração.

A

Utilizar proteínas que podem ser obtidas de empresas de biologia molecular que impedem a ação das RNAse por inibir a função catalítica destas enzimas.

B

Aquecer as amostras biológicas antes da extração por 10 minutos a 80°C.

C

Utilizar dietil pirocarbonato (diethyl pyrocarbonate – DEPC) nas soluções preparadas para a extração de RNA.

D

Expor a vidraria a ser utilizada durante a extração a temperaturas de 200°C por três a quatro horas.

E

Trabalhar sempre com luvas, durante a manipulação das amostras.

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Q568735

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568735 Biomedicina - Análises Clínicas

Os métodos de normalização são fundamentais para um experimento bem sucedido de microarranjos de DNA. Estes métodos são necessários para corrigir uma série de variáveis intrínsecas do experimento.

Dentre as afirmativas a seguir, assinale a que não corresponde a uma variável presente em um experimento de microarranjos de DNA.

A

Eficiência de hibridização.

B

Sensibilidade da medida do sinal.

C

Número de células na amostra.

D

Quantidade de elementos impressos no microarranjo.

E

Eficiência do isolamento do RNA total.

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Q568734

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568734 Biomedicina - Análises Clínicas

Sobre as diferenças entre o método didesoxi e o método de utilizado em sequenciadores automáticos, assinale a alternativa incorreta.

A

O método didesoxi é usualmente dependente de radioatividade, enquanto o dos sequenciadores automáticos utiliza corantes fluorescentes.

B

No método didesoxi são necessárias quatro reações distintas para uma mesma sequência, enquanto que nos sequenciadores automáticos apenas uma reação é utilizada.

C

A interpretação do resultado do método didesoxi depende da revelação de um autoradiagrama, enquanto nos sequenciadores automáticos o resultado é revelado em tempo real em um gráfico.

D

O método didesoxi depende da migração em gel de poliacrilamida, enquanto que nos sequenciadores automáticos outra matrizes de migração podem ser utilizadas.

E

O método didesoxi depende de uma reação de PCR para obtenção dos resultados, enquanto nos sequenciadores automáticos o PCR não é necessário.

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Q568733

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568733 Biomedicina - Análises Clínicas

A alternativa que melhor define um gene de referência ou gene normalizador em um PCR quantitativo para avaliação da expressão é um gene:

A

muito expresso.

B

pouco expresso.

C

com expressão conspícua em todas as células.

D

com expressão em uma situação particular fisiológica.

E

não expresso.

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Q568732

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568732 Biomedicina - Análises Clínicas

O PCR quantitativo pode ser utilizado para avaliar o nível de expressão de um determinado gene. No entanto, este ensaio apresenta um problema frequente que pode distorcer os resultados, a avaliação da amplificação de uma amostra que não está mais na fase exponencial de amplificação.

Assinale a alternativa com a melhor opção para resolver esse problema.

A

Otimizar as concentrações de iniciadores da reação de PCR quantitativo.

B

Otimizar a concentração de fita molde inicial.

C

Otimizar o número de ciclos de amplificação.

D

Otimizar a temperatura de anelamento dos iniciadores.

E

Otimizar a temperatura de alongamento/polimerização da Taq polimerase.

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Q568731

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568731 Biomedicina - Análises Clínicas

Para o desenho do iniciadores ou oligonucleotídeos para reação de PCR, algumas orientações precisam ser seguidas de forma a garantir o sucesso da amplificação.

Selecione dentre as sentenças abaixo aquela que corresponde a uma orientação errada.

A

Os iniciadores devem ter entre 18 e 22 nucleotídeos.

B

A temperatura de desnaturação dos iniciadores deve estar entre 52 e 58 °C salvo em reações de PCR não usuais.

C

O conteúdo de CG (número total de Guaninas e Citosinas no iniciador em relação ao número total de bases) deve estar entre 40 e 60%.

D

Mais de três guaninas ou citosinas devem ser preferencialmente colocadas nos últimos cinco nucleotídeos da ponta 3' dos iniciadores.

E

Regiões de complementaridade entre os dois iniciadores de uma reação de PCR devem ser evitadas.

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Q568730

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568730 Biomedicina - Análises Clínicas

Dentre as sentenças abaixo, selecione aquela que descreve uma etapa não presente no procedimento de uma reação de PCR padrão.

A

Resfriamento da amostra a 16 °C por 30 segundos a cada ciclo.

B

Anelamento dos iniciadores no DNA alvo a 55 °C por um minuto a cada ciclo.

C

Desnaturação da amostra a 95 °C por 40 segundos a cada ciclo.

D

Alongamento/Polimerização a 72 °C por um minuto a cada ciclo.

E

Desnaturação inicial da amostra a 95°C por cinco minutos.

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Q568728

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568728 Biomedicina - Análises Clínicas

Dentre as técnicas a seguir, assinale a que não é considerada uma técnica de genômica funcional.

A

Microarranjos de DNA.

B

Hibridização in situ.

C

Estudo da interação gênica por análise supressor em larga escala.

D

Perturbação gênica ou nocaute gênico em larga escala.

E

Estudo da interação gênica pelo sistema duplo híbrido em larga escala.

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Q568727

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568727 Biomedicina - Análises Clínicas

Transcriptomas podem ter uma alta complexidade e conter centenas de milhares de mRNAs diferentes, em diferentes proporções. Portanto, para caracterização do transcriptoma é necessário identificar e, idealmente, determinar as abundâncias relativas de cada transcrito.

Sobre as técnicas mais populares de análise de transcritoma, assinale a alternativa incorreta.

A

A análise serial da expressão gênica (SAGE) identifica sequências pequenas de até 12pb.

B

O SAGE utiliza de enzimas de restrição não usuais, que não clivam o sítio de reconhecimento, mas uma em uma região de 10 a 14 nucleotídeos a jusante.

C

O SAGE, além de identificar individualmente mRNAs, permite a informação exata da abundância destes RNAs.

D

A técnica de microarranjos de DNA permite uma comparação mais acurada que o SAGE da quantidade de um determinado mRNA.

E

Na técnica de microarranjos de DNA, marcadores fluorescentes são utilizados e o sinal de hibridização pode ser detectado por meio de microscopia confocal.

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Q568726

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568726 Biomedicina - Análises Clínicas

Uma forma de amplificar um fragmento de DNA é a clonagem em plasmídeo e a transformação de uma cepa bacteriana para posterior extração do DNA plasmidial. A classificação mais utilizada para plasmídeos é a baseada em características do DNA.

Sobre os cinco principais tipos de plasmídeos, assinale a alternativa incorreta.

A

Plasmídeos de resistência – Carregam genes que conferem à bactéria hospedeira resistência a um ou mais agentes antibacteriano como, por exemplo, o da ampicilina.

B

Plasmídeos de virulência – Conferem patogenicidade à bactéria hospedeira.

C

Plasmídeos de fertilidade (F) – Possuem a característica de promover a transferência de plasmídeos.

D

Plasmídeos degradativos – Carregam genes que permitem a bactéria hospedeira a metabolizar moléculas não usualmente metabolizadas.

E

Plasmídeos Col – Carregam genes para as colicinas, proteínas que promovem o crescimento bacteriano.

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Q568725

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568725 Biomedicina - Análises Clínicas

Uma série de técnicas são usualmente utilizadas para estudo da expressão de genes. Sobre técnicas de análise da expressão gênica, assinale a alternativa incorreta.

A

O Northern blot é uma técnica de avaliação da expressão gênica que apresenta tipicamente uma alta sensibilidade e necessita de pequenas quantidades de material biológico, quando comparada a outras técnicas como o RT-PCR.

B

O RT-PCR é uma técnica para avaliação da expressão gênica que depende de uma etapa de síntese de cDNA.

C

A técnica de RT-PCR em tempo real é mais acurada para a avaliação da expressão gênica quando comparada a outras técnicas como o RT-PCR.

D

O hibridização in situ de mRNA permite identificar a localização espacial da expressão gênica em um determinado tecido ou órgão.

E

Para a realização da hibridização in situ, a preparação do tecido ou órgão do organismo em questão deve proteger o mRNA da degradação e também preservar as estruturas celulares.

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Q568724

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568724 Biomedicina - Análises Clínicas

Plasmídeos são moléculas circulares de DNA encontrados em bactérias. Elas são utilizados como vetores para a clonagem de genes e portanto fundamentais para o estudo de genes.

Sobre as características típicas encontradas em plasmídeos utilizados para clonagem, assinale a alternativa incorreta.

A

O plasmídeo precisa ter um marcador de seleção que confere resistência a bactéria a um antibiótico específico.

B

O plasmídeo precisa ter uma origem de replicação, que permite a multiplicação independente do DNA bacteriano.

C

O plasmídeo usualmente tem sítio múltiplo de clonagem que permite a utilização de várias enzimas de restrição durante a clonagem.

D

O plasmídeo precisa ter mais de 10.000 pb de forma que seja estável na bactéria.

E

O plasmídeo usualmente tem um sítio para anelamento de iniciadores de PCR para sequenciamento M13 próximos a sítio de inserção.

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Q568723

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568723 Biomedicina - Análises Clínicas

A enzima DNA polimerase é responsável pela replicação do DNA, no entanto ela não atua sozinha durante este processo. Assinale abaixo a afirmativa que indica um componente que não atua na replicação do DNA.

A

A enzima primase.

B

A enzima helicase.

C

A enzima girase.

D

As proteínas de ligação ao DNA unifilamentar.

E

A enzima RNA polimerase II.

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Q568722

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568722 Biomedicina - Análises Clínicas

Sobre alinhamentos de sequências de DNA, é correto afirmar que:

A

apenas no alinhamento par a par, a homologia é garantida.

B

todos algoritmos de alinhamento buscam maximizar a homologia entre as sequências.

C

o alinhamento múltiplo garante a paralogia, mas não a ortologia das sequências.

D

o alinhamento par a par garante a paralogia, mas não a ortologia das sequências.

E

a paralogia é homologia de genes duplicados.

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Q568721

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568721 Biomedicina - Análises Clínicas

Um pesquisador está tentando sequenciar um gene conservado de um pombo. Entretanto, no momento de escolher os primers para PCR, ele observou que não dispõe de primers, para as regiões flanqueadoras do gene, específicos para Aves. Os primers disponíveis no laboratório estão os que foram desenhados para as espécies indicadas nas alternativas.

Assinale a melhor escolha de forma a otimizar a probabilidade de amplificação do fragmento em questão.

A

Humano.

B

Anfíbio.

C

Ouriço do mar.

D

Mosquito.

E

Cefalocordado.

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Q568720

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568720 Biomedicina - Análises Clínicas

A maior parte dos algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências faz uso de uma matriz de pontos (dot-matrix). Na primeira fase do alinhamento par a par, cada par de sequências é disposto nesta matriz com uma sequência na primeira linha e a outra na primeira coluna.

Todos os pares possíveis de sequências são analisados na matriz de pontos, onde um ponto indica ____________ das duas sequências a serem alinhadas par a par.

Assinale a alternativa que complete corretamente a frase acima.

A

homologia entre os nucleotídeos

B

homologia entre as posições do alinhamento múltiplo final

C

distância física idêntica a partir do ATG entre os nucleotídeos

D

identidade entre os nucleotídeos

E

evento indel (inserção-deleção) naquela posição

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Q568719

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568719 Biomedicina - Análises Clínicas

Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é:

Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

A explicação mais provável é que:

A

a sequência 2 é de uma espécie diferente das outras três.

B

a reação de sequenciamento da espécie 2 deve estar contaminada.

C

ocorreu um erro na leitura do eletroferograma da espécie 2.

D

entre o terceiro e o quarto aminoácido deve haver uma dobra na proteína que aumentou a probabilidade de uma mutação.

E

o genoma da espécie apresenta um pseudogene para a proteína de modo que uma mudança no quadro de leitura não afetou a viabilidade do organismo.

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Q568718

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568718 Biomedicina - Análises Clínicas

Um pesquisador estava fazendo um estudo comparativo entre genomas de duas espécies de plantas. Em particular, ele analisou sequências de dois genes não homólogos codificadores de proteínas. Dentre as metodologias de análise, ele calculou a proporção de nucleotídeos diferentes pelo total de nucleotídeos comparados (p).

Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. Quando comparado com íntrons do mesmo gene, os éxons vão mostrar um p maior entre as espécies de plantas.

II. As proteínas não homólogas irão mostrar uma proporção de 25% de aminoácidos idênticos.

III. O numerador de p é exatamente o somatório do número de transições com o de transversões entre as sequências.

Assinale:

A

se apenas a afirmativa I estiver correta.

B

se apenas as afirmativas I e III estiverem corretas.

C

se todas as afirmativas estiverem corretas.

D

se apenas a afirmativa III estiver correta.

E

se apenas as afirmativas I e II estiverem corretas.

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Q568717

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568717 Biomedicina - Análises Clínicas

Veja o gráfico abaixo que destaca o aumento na distância observável entre duas sequências com o aumento do número de mutações acumuladas desde o ancestral comum entre elas (distância real).

Imagem associada para resolução da questão

Imagem associada para resolução da questão

A partir do gráfico, analise as afirmativas a seguir.

I. Sequências mais próximas filogeneticamente apresentam uma proporção menor de variação genética escondida.

II. Caso o número de nucleotídeos diferentes (A,T,C,G) fosse seis ao invés de quatro, a distância observável teria um platô abaixo do observado.

III. A distância observável varia de zero a um, enquanto a real de zero a infinito.

Assinale:

A

se apenas a afirmativa I estiver correta.

B

se apenas as afirmativas I e III estiverem corretas

C

se todas as afirmativas estiverem corretas

D

se apenas as afirmativas II e III estiverem corretas

E

se apenas a afirmativa II estiver correta.

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Q568716

Ano: 2010 Banca: FGV Órgão: FIOCRUZ Prova: FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA |

Q568716 Biomedicina - Análises Clínicas

Um pesquisadora coletou no campo vários indivíduos que ela classificou como pertencentes ao gênero Drosophila, mas sem designar espécies. Após o sequenciamento de uma região gênica, ela alinhou duas sequências, cujo número de diferenças está mostrado na tabela par a par abaixo. As células da diagonal indicam o número de bases idênticas e nas demais células, o número de substituições observáveis na comparação de sequências alinhadas de dois indivíduos.

Imagem associada para resolução da questão

Sobre a tabela, analise as afirmativas a seguir.

I. As sequências pertencem a mesma espécie, pois o número de diferenças entre elas é baixo.

II. As sequências estão evoluindo sob ação da seleção purificadora.

III. Existe um desvio a favor das transições, esperado em regiões gênicas não codificadoras de proteínas.

Assinale:

A

se todas as afirmativas estiverem corretas.

B

se apenas a afirmativa III estiver correta.

C

se apenas as afirmativas I e III estiverem corretas.

D

se apenas a afirmativa II estiver correta.

E

se apenas as afirmativas I e II estiverem corretas.

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